Коюкі вважає життя нудним, доки не зустрічає Рюсуке, місцевого гітарного героя з поганою репутацією. Двоє невдах створюють гурт і вирушають рятувати рок-н-рол. Якщо хлопці зможуть залишитися вірними своєму баченню, на них чекає весь світ.
Через два роки після війни напруженість знову зростає. Шінн, чия родина загинула, переслідується. Атрун намагається захистити Кагаллі, запобігаючи конфлікту, оскільки нові мобільні костюми ZAFT крадуть.
Історія відбувається в альтернативній реальності, де невеликий відсоток дітей проявляє надлюдські здібності після досягнення статевої зрілості. Основна увага приділяється Ю Отосаці, старшокласнику, який пробуджує здатність тимчасово опановувати інших, що привертає до себе увагу Нао Томорі,
Соціально незграбна Томоко мріє стати популярною старшокласницею, але її мета може бути далі, ніж вона думає.
Велика група тих, хто вижив, шукає притулку під час подорожі поїздом після того, як на їхню станцію напали агресивні нежить на ім'я Кабане.
У сучасному Токіо з'являються ворота, що відкривають доступ до фентезійного світу. Формується японський військовий загін для встановлення зв'язків між обома світами.
Подібно до оригінальної Valkyria Chronicles для PS3, дія цієї гри відбувається у вигаданій країні Європа під час війни 1935 року, але розповідає про битви Безіменного загону, а не Галлійської армії. Члени цього спеціального загону залишають свої імена та минуле, вступаючи до нього, і відтоді їх
Коли імперські війська атакують невелике прикордонне містечко Брюль, Велкін Гюнтер змушений воювати разом з капітаном міської варти Алісією. Разом зі своєю сестрою Ізарою троє втікають до столиці Галлії та приєднуються до ополчення країни.
Що б ви зробили, якби могли зупинити час? Морітані, наприклад, використовує свою незвичайну здатність зупиняти час на три хвилини на день, щоб спостерігати за людьми навколо. Одного разу вона вирішує «спостерігати» за трусиками кумира класу Муракамі, але опиняється у дуже компрометуючій ситуації,
Історія групи молодих друзів та таємничих подій, що відбуваються у сільському селі Хінамідзава.
Після Джабуро, EFF планують операцію із захоплення Одеси, штаб-квартири атакувальних сил Зіона. Біла База прямує до Белфаста для поповнення запасів. Однак Біла База отримує новий наказ: вирушити на острів, відомий як «Острів без повернення».
Після відкриття подорожей у часі, студент університету та його колеги повинні використати свої знання про це, щоб зупинити злу організацію та її диявольські плани.